β-环糊精的内腔尺寸在0.5~0.8 nm，水分子的尺寸约为0.1 nm。通常在水溶液中，β-环糊精的内腔总是溶剂化的，会有水分子与它结合。但是β-环糊精的内腔具有疏水性，是不完全的溶剂化。